RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560890.5

APH1B-210, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-210ENST00000560890 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.97□□□□□ -1.45
APH1B-210ENST00000560890 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.97□□□□□ -1.45
APH1B-210ENST00000560890 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.97□□□□□ -1.45
APH1B-210ENST00000560890 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.97□□□□□ -1.45
APH1B-210ENST00000560890 COL7A1Q02388 2944 aa5.96□□□□□ -1.45
APH1B-210ENST00000560890 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.96□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.96□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.96□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.96□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.96□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.96□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.96□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.95□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 Q6ZN92 141 aa5.95□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 RMI2Q96E14 147 aa5.95□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 TMEM141Q96I45 108 aa5.95□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 VCX2Q9H322 139 aa5.95□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.94□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 SERF1AO75920 110 aa5.94□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 MIAQ16674 131 aa5.94□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 ENHOQ6UWT2 76 aa5.94□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 C6orf223Q8N319 242 aa5.94□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 Q9HAA7 133 aa5.94□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 PRR34Q9NV39 138 aa5.94□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 COX11Q9Y6N1 276 aa5.94□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 CCL25O15444 150 aa5.93□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 ATP5LO75964 103 aa5.93□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 SS18Q15532 418 aa5.93□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 PMCHL1Q16048 86 aa5.93□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 TIMM17AQ99595 171 aa5.93□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.93□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.93□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.92□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.92□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 NUPR1O60356 82 aa5.92□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 S100A6P06703 90 aa5.92□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.92□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.91□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.91□□□□□ -1.46
APH1B-210ENST00000560890 H3BS24 57 aa5.91□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.91□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 FABP4P15090 132 aa5.9□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 AMELXQ99217 191 aa5.9□□□□□ -1.46
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APH1B-210ENST00000560890 BAALCQ8WXS3 180 aa5.89□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 FAM104AQ969W3 186 aa5.89□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.89□□□□□ -1.47
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APH1B-210ENST00000560890 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.88□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.88□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 S100A2P29034 98 aa5.88□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 XCL1P47992 114 aa5.88□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.88□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.88□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.88□□□□□ -1.47
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APH1B-210ENST00000560890 UBE2D1P51668 147 aa5.87□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 CFAP161Q6P656 301 aa5.87□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.87□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 RTL8CO15255 209 aa5.86□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 MALP21145 153 aa5.86□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
APH1B-210ENST00000560890 HERVK_113P63121 156 aa5.86□□□□□ -1.47
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