RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 MIAQ16674 131 aa4.24□□□□□ -1.73
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PTPRB-211ENST00000552253 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TEX29Q8N6K0 151 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TMEM101Q96IK0 257 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 XCL2Q9UBD3 114 aa4.24□□□□□ -1.73
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PTPRB-211ENST00000552253 Q6Q795 121 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 Q9H8V8 135 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 CRLF1O75462 422 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-211ENST00000552253 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
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