RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 HEATR5AQ86XA9 2040 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf77Q96MU5 243 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 HCG22E2RYF7 251 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 PCDH15Q96QU1 1955 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01006Q8NI28 216 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 DOCK10Q96BY6 2186 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-30P01768 117 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 WT1-ASQ06250 92 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB136Q30KP8 78 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0J9YY99 117 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 MED14OSP0DP75 135 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0J9YXY3 114 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
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PTPRB-210ENST00000551525 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 DOCK11Q5JSL3 2073 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 ABCA1O95477 2261 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WVE0 104 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0G2JRQ6 117 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZRU5 148 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRSQ13332 1948 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 IGF2RP11717 2491 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WZ39 114 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 hDV103S1A0JD37 113 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRB-210ENST00000551525 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 PCNTO95613 3336 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0A0MQY5 61 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRB-210ENST00000551525 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRB-210ENST00000551525 MED13Q9UHV7 2174 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRB-210ENST00000551525 SPAG11BQ08648 103 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRB-210ENST00000551525 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 CEP350Q5VT06 3117 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRB-210ENST00000551525 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 K7EIM0 57 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 CTSGP08311 255 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 Q8TAT8 98 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRB-210ENST00000551525 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf33Q8WU49 177 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01554Q52M75 96 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 LRRK1Q38SD2 2015 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00205P59089 165 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 FHL3Q13643 280 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV2-23P01705 113 aa4.66□□□□□ -1.66
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