RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 IGKCP01834 107 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM262E9PQX1 116 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 LELP1Q5T871 98 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 AMELXQ99217 191 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 DNHD1Q96M86 4753 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 hDV102S1A0JD36 115 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 PLNP26678 52 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 MAJINQ3KP22 176 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 SPATA45Q537H7 98 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 FAM104AQ969W3 186 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 TIRAPP58753 221 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 IGLL5B9A064 214 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 PKIAP61925 76 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 PRO1933Q9H354 126 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 RBX1P62877 108 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 MPV17L2Q567V2 206 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 A0A0J9YXV3 536 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 C11orf86A6NJI1 115 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 IGLC3P0DOY3 106 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 UBE2D1P51668 147 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 ESRGQ1W209 222 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 STPG4Q8N801 248 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 A0A1B0GUV1 79 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 TCTAP57738 103 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 NFE4Q86UQ8 179 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 TSTD3H0UI37 97 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-209ENST00000549308 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 HERVK_113P61574 105 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-30P01768 117 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-33P01772 117 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 SEC11AP67812 179 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 Q8N3U1 123 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 NMUP48645 174 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 CCL18P55774 89 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 HERVK_113P63121 156 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 C14orf144Q96I85 54 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 NUPR2A6NF83 97 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM223A0PJW6 202 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 COX6A2Q02221 97 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 SS18Q15532 418 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRR-209ENST00000549308 H3BRM9 83 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 REG3AQ06141 175 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 KLK12Q9UKR0 248 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 APLNQ9ULZ1 77 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 COX8AP10176 69 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 CRPP02741 224 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 SPINK8P0C7L1 97 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRR-209ENST00000549308 LEPROTO15243 131 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 CCL25O15444 150 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 PCP2Q8IVA1 136 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 SIVA1O15304 175 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 DDTP30046 118 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 XCL1P47992 114 aa8.2□□□□□ -1.1
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