RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 DPM2O94777 84 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3-53P01767 116 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 RPL39P62891 51 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 RHOHQ15669 191 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 PCP2Q8IVA1 136 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 FAM104AQ969W3 186 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 KIR2DL4Q99706 377 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 LINC01549A6NIU2 74 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 F8VRH5 84 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 I3L3M4 83 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 SIVA1O15304 175 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 G0S2P27469 103 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 INSL3P51460 131 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TCTAP57738 103 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TMEM141Q96I45 108 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TIMM17AQ99595 171 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 MUC4Q99102 2169 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 A0A087X002 238 aa3.81□□□□□ -1.8
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TRDN-205ENST00000546248 BATFQ16520 125 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 MPV17L2Q567V2 206 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 Q6ZTI0 123 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 OR4C5Q8NGB2 326 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CST9LQ9H4G1 147 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 NF1P21359 2839 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.81□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 SONP18583 2426 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TRAV4A0A0B4J268 109 aa3.8□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 C11orf86A6NJI1 115 aa3.8□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 PLNP26678 52 aa3.8□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 NMUP48645 174 aa3.8□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 PMVKQ15126 192 aa3.8□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 RRN3P1Q2M238 152 aa3.8□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.8□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.8□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 C16orf74Q96GX8 76 aa3.8□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CENPEQ02224 2701 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 NOTCH2Q04721 2471 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 ZANQ9Y493 2812 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 ACANP16112 2415 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 Q6ZVH6 145 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 AMELXQ99217 191 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 HIGD1BQ9P298 99 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 HIVEP2P31629 2446 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 AGRNO00468 2067 aa3.79□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CUBNO60494 3623 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 E9PLD3 99 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 TAX1BP3O14907 124 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 CRYBA4P53673 196 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 EMP1P54849 157 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 UBE2D3P61077 147 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 UBE2D2P62837 147 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 HSD52Q0P140 79 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.78□□□□□ -1.8
TRDN-205ENST00000546248 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
TRDN-205ENST00000546248 SORL1Q92673 2214 aa3.77□□□□□ -1.81
TRDN-205ENST00000546248 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa3.77□□□□□ -1.81
TRDN-205ENST00000546248 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.77□□□□□ -1.81
TRDN-205ENST00000546248 A0A0J9YXV3 536 aa3.77□□□□□ -1.81
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