RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533903.1

ZBED5-208, Transcript of zinc finger BED-type containing 5, human

TSL 1 (best)

Gene ZBED5, Length 3,214 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZBED5-208	ENST00000533903	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	NXPH4	O95158	308 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TCL1B	O95988	128 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	IFITM1	P13164	125 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TMEM141	Q96I45	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903		A0A087WZ39	114 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	APELA	P0DMC3	54 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	PMVK	Q15126	192 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903		Q6ZVQ6	151 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	AMELX	Q99217	191 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	CFC1B	P0CG36	223 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	CFC1	P0CG37	223 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TIMM17A	Q99595	171 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903		M0R3E3	92 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	AGRN	O00468	2067 aa		5	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903		J3QQQ9	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903		H3BT86	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	CTSG	P08311	255 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	PSMB2	P49721	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	FXYD7	P58549	80 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	HERVK_113	P61574	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	OVOL1	O14753	267 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	SLC25A20	O43772	301 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	ACYP1	P07311	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903		M0R2P5	195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	SNCG	O76070	127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	METTL26	Q96S19	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	PFN2	P35080	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	NDUFC2	O95298	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZBED5-208	ENST00000533903	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	LEPROT	O15243	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	ATR	Q13535	2644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	TSHB	P01222	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZBED5-208	ENST00000533903	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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