RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.72□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.72□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 MIAQ16674 131 aa9.71□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.71□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 ORMDL3Q8N138 153 aa9.71□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.71□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 C16orf90A8MZG2 172 aa9.7□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 NPYP01303 97 aa9.7□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 FCER1GP30273 86 aa9.7□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 REG3AQ06141 175 aa9.7□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.7□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.7□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 KIR2DL4Q99706 377 aa9.7□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.7□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 FGF6P10767 208 aa9.69□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 PRELID3AQ96N28 172 aa9.69□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.69□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.69□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 WFDC2Q14508 124 aa9.68□□□□□ -0.86
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TSTA3-208ENST00000528920 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.67□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 Q8N814 137 aa9.67□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 BAALCQ8WXS3 180 aa9.67□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.67□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.66□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 PRSS47A8MTI9 375 aa9.66□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 LECT2O14960 151 aa9.66□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.66□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM101Q96IK0 257 aa9.66□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 NDUFA6P56556 154 aa9.65□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.65□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TSTA3-208ENST00000528920 HSPG2P98160 4391 aa9.64□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.64□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 S100A6P06703 90 aa9.64□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.64□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 C5orf52A6NGY3 159 aa9.63□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.63□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM18Q96B42 140 aa9.63□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.63□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.62□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.62□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 BAGE3Q86Y29 109 aa9.62□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.62□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.62□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.62□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.61□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.61□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.61□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 Q8N8P6 123 aa9.61□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 USP17L23D6RBM5 183 aa9.6□□□□□ -0.87
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TSTA3-208ENST00000528920 C14orf177Q52M58 125 aa9.6□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 SERF1AO75920 110 aa9.59□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 CDK2AP2O75956 126 aa9.59□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 GCSHP23434 173 aa9.59□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.58□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.58□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 NUPR1O60356 82 aa9.58□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP10-1P60331 282 aa9.58□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.58□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.58□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.58□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.58□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 K7EMI3 77 aa9.57□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00614P0C842 121 aa9.57□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 Q6ZUT4 128 aa9.57□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.56□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.56□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 LINC01546A6NGU7 62 aa9.56□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 PRSS1P07477 247 aa9.56□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 SS18Q15532 418 aa9.56□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.56□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.56□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 IFITM10A6NMD0 228 aa9.55□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 CCL25O15444 150 aa9.55□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 FAM104AQ969W3 186 aa9.55□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.55□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 XCL1P47992 114 aa9.54□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 FOXI1Q12951 378 aa9.54□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 FA2HQ7L5A8 372 aa9.54□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 HSBP1O75506 76 aa9.53□□□□□ -0.88
TSTA3-208ENST00000528920 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.53□□□□□ -0.88
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