RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 A0A096LNT2 108 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-217ENST00000524534 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.28□□□□□ -1.08
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PTPRK-217ENST00000524534 Q6YL49 198 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-217ENST00000524534 COX7A2LO14548 114 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-217ENST00000524534 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-217ENST00000524534 SPG11Q96JI7 2443 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-217ENST00000524534 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-217ENST00000524534 ITPR1Q14643 2758 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-217ENST00000524534 INSP01308 110 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRK-217ENST00000524534 PEMTQ9UBM1 199 aa8.25□□□□□ -1.09
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PTPRK-217ENST00000524534 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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PTPRK-217ENST00000524534 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRK-217ENST00000524534 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRK-217ENST00000524534 IGKV2D-28P01615 120 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRK-217ENST00000524534 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 FLNCQ14315 2725 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 C5orf38Q86SI9 138 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 Q9HAA7 133 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 CXCL5P42830 114 aa8.12□□□□□ -1.11
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