RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 PYY3Q5JQD4 70 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 A0A096LPF7 62 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 H0Y8G0 127 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 UBE2L6O14933 153 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 LINC01545Q5VT33 79 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 Q8N976 141 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 FGF6P10767 208 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 TIRAPP58753 221 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 BAALCQ8WXS3 180 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 VCX2Q9H322 139 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 DNHD1Q96M86 4753 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 A0A087WX48 190 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 PMVKQ15126 192 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 LELP1Q5T871 98 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM101Q96IK0 257 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 CST9LQ9H4G1 147 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 TENM3Q9P273 2699 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 GAGE6Q13070 117 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM262E9PQX1 116 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 PKIAP61925 76 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 FAM104AQ969W3 186 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 AMELXQ99217 191 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 A0A1B0GUV1 79 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 IGLL5B9A064 214 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 F8VRH5 84 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 DPM2O94777 84 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 Q6ZUT4 128 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 C14orf144Q96I85 54 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 IGKCP01834 107 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 PLNP26678 52 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 ESRGQ1W209 222 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 ATOH7Q8N100 152 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 RBX1P62877 108 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 VAMP8Q9BV40 100 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 A0A1B0GV90 55 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 NUPR2A6NF83 97 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 MPV17L2Q567V2 206 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-210ENST00000519815 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 TSTD3H0UI37 97 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 IGLC3P0DOY3 106 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 UBE2D1P51668 147 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 CCL18P55774 89 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 NFE4Q86UQ8 179 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 A0A0J9YXV3 536 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 hDV102S1A0JD36 115 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 DDTP30046 118 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 SEC11AP67812 179 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 MAJINQ3KP22 176 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 C11orf86A6NJI1 115 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 TCTAP57738 103 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 RNF151Q2KHN1 245 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 SPATA45Q537H7 98 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-210ENST00000519815 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.12□□□□□ -1.27
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