RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.68□□□□□ -0.86
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SH3BP2-208ENST00000504294 CFAP161Q6P656 301 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 C16orf90A8MZG2 172 aa9.67□□□□□ -0.86
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SH3BP2-208ENST00000504294 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
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SH3BP2-208ENST00000504294 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.65□□□□□ -0.86
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SH3BP2-208ENST00000504294 BAALCQ8WXS3 180 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.63□□□□□ -0.87
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SH3BP2-208ENST00000504294 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.62□□□□□ -0.87
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SH3BP2-208ENST00000504294 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.61□□□□□ -0.87
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SH3BP2-208ENST00000504294 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-208ENST00000504294 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAH2Q9P225 4427 aa9.61□□□□□ -0.87
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SH3BP2-208ENST00000504294 USP17L23D6RBM5 183 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-208ENST00000504294 GCSHP23434 173 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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SH3BP2-208ENST00000504294 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC01546A6NGU7 62 aa9.59□□□□□ -0.87
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SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.59□□□□□ -0.87
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SH3BP2-208ENST00000504294 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.58□□□□□ -0.88
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SH3BP2-208ENST00000504294 Q6ZUT4 128 aa9.58□□□□□ -0.88
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SH3BP2-208ENST00000504294 MALP21145 153 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-208ENST00000504294 XCL1P47992 114 aa9.57□□□□□ -0.88
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SH3BP2-208ENST00000504294 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-208ENST00000504294 COX7A2LO14548 114 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXI1Q12951 378 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-208ENST00000504294 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.56□□□□□ -0.88
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SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-208ENST00000504294 hDV102S1A0JD36 115 aa9.55□□□□□ -0.88
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SH3BP2-208ENST00000504294 S100A1P23297 94 aa9.54□□□□□ -0.88
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SH3BP2-208ENST00000504294 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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SH3BP2-208ENST00000504294 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 AMELXQ99217 191 aa9.52□□□□□ -0.89
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SH3BP2-208ENST00000504294 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 HERVK_113P63121 156 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-208ENST00000504294 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP2-208ENST00000504294 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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