RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
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PGGT1B-204ENST00000503638 ESDP10768 282 aa9□□□□□ -0.97
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PGGT1B-204ENST00000503638 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.88□□□□□ -0.99
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PGGT1B-204ENST00000503638 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.87□□□□□ -0.99
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PGGT1B-204ENST00000503638 LINC01549A6NIU2 74 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
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PGGT1B-204ENST00000503638 ERASQ7Z444 233 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8N814 137 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.86□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 IGIPA6NJ69 53 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 MALP21145 153 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 C14orf177Q52M58 125 aa8.85□□□□□ -0.99
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