RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-208ENST00000489554 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.23□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.23□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 PKHD1P08F94 4074 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 GAGE12JA6NER3 117 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 SIVA1O15304 175 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 GYPEP15421 78 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 UBE2D3P61077 147 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 UBE2D2P62837 147 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 TNP2Q05952 138 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 GAGE1Q13065 139 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 GAGE4Q13068 117 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 GAGE5Q13069 117 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 GAGE13Q4V321 117 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 TOMM6Q96B49 74 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 TMEM141Q96I45 108 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.22□□□□□ -1.25
SCAMP4-208ENST00000489554 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 H0Y8G0 127 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 I3L3M4 83 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 M0R143 59 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 IGLC3P0DOY3 106 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 ERASQ7Z444 233 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 HERC2O95714 4834 aa7.21□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 PKD1P98161 4303 aa7.2□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 PLNP26678 52 aa7.2□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.2□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.2□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.2□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 DPM2O94777 84 aa7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 TSHBP01222 138 aa7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 NPSP0C0P6 89 aa7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 ATOH7Q8N100 152 aa7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 C14orf144Q96I85 54 aa7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 TIMM17AQ99595 171 aa7.19□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 A0A087WX48 190 aa7.18□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.18□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 K7EP13 123 aa7.18□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 IGKCP01834 107 aa7.18□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.18□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 F8VRH5 84 aa7.17□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 TIRAPP58753 221 aa7.17□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 ODF1Q14990 250 aa7.17□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.17□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.17□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 C16orf90A8MZG2 172 aa7.16□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 DLEU1O43261 78 aa7.16□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 COX8AP10176 69 aa7.16□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 NFE4Q86UQ8 179 aa7.16□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.16□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 hDV102S1A0JD36 115 aa7.15□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.15□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 CTAG1AP78358 180 aa7.15□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 PMVKQ15126 192 aa7.15□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.15□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.15□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.15□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.15□□□□□ -1.26
SCAMP4-208ENST00000489554 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.14□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 HERVK_113P61574 105 aa7.14□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 COTL1Q14019 142 aa7.14□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.14□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.14□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.13□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 IGIPA6NJ69 53 aa7.13□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.13□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 BAALCQ8WXS3 180 aa7.13□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 EREGO14944 169 aa7.12□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 CDK2AP2O75956 126 aa7.12□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 MAJINQ3KP22 176 aa7.12□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.12□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 LELP1Q5T871 98 aa7.12□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 FAM104AQ969W3 186 aa7.12□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 VCX2Q9H322 139 aa7.12□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.12□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.11□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.11□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.11□□□□□ -1.27
SCAMP4-208ENST00000489554 Q8N3U1 123 aa7.11□□□□□ -1.27
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