RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.99□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.99□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 ATP5LO75964 103 aa7.98□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 LINC00310P59036 64 aa7.98□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 GAGE6Q13070 117 aa7.98□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.98□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.98□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 Q9H8V8 135 aa7.98□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 RBX1P62877 108 aa7.97□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 TTC32Q5I0X7 151 aa7.97□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.97□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.97□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.97□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
NISCH-211ENST00000488243 A0A096LNJ9 63 aa7.96□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 IGIPA6NJ69 53 aa7.96□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 CCL25O15444 150 aa7.96□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 LEPROTL1O95214 131 aa7.96□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZN92 141 aa7.96□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.96□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.96□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 PKHD1P08F94 4074 aa7.95□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 C5orf52A6NGY3 159 aa7.95□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 NUPR1O60356 82 aa7.95□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 MPV17L2Q567V2 206 aa7.95□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.95□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.95□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 S100A2P29034 98 aa7.94□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.94□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.94□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 PMCHL1Q16048 86 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 VCX2Q9H322 139 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 PRR34Q9NV39 138 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 DNAH2Q9P225 4427 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3-30P01768 117 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3-33P01772 117 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 CRPP02741 224 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 MIAQ16674 131 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 Q8N976 141 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 AMELXQ99217 191 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 AKR1D1P51857 326 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 SEC11AP67812 179 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 REG3AQ06141 175 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 PMVKQ15126 192 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 NFE4Q86UQ8 179 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 RMI2Q96E14 147 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 KLK12Q9UKR0 248 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 COX11Q9Y6N1 276 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 PRSS1P07477 247 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 SS18Q15532 418 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZUT4 128 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 BAALCQ8WXS3 180 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-211ENST00000488243 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.9□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 IFITM10A6NMD0 228 aa7.89□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 FABP4P15090 132 aa7.89□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 FAM104AQ969W3 186 aa7.89□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.89□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 CST9LQ9H4G1 147 aa7.89□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.88□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 PET117Q6UWS5 81 aa7.88□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 ENHOQ6UWT2 76 aa7.88□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 UBE2WQ96B02 151 aa7.88□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 TM2D2Q9BX73 214 aa7.88□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZR54 194 aa7.87□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.87□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 Q8N3U1 123 aa7.87□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.86□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.86□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 UBE2D1P51668 147 aa7.86□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 HERVK_113P63121 156 aa7.86□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.86□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 HSPG2P98160 4391 aa7.85□□□□□ -1.15
NISCH-211ENST00000488243 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.8 ms