RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 MT2AP02795 61 aa-1.06□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 MT1EP04732 61 aa-1.06□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 CCL18P55774 89 aa-1.06□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-1.06□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-1.06□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 SLC25A26Q70HW3 274 aa-1.06□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 DYNLRB2Q8TF09 96 aa-1.06□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-1.06□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 H7BZZ5 65 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 CCL22O00626 93 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 IFNA17P01571 189 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 APOC3P02656 99 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 PCBD1P61457 104 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 B2MP61769 119 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 BTG2P78543 158 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 PLGLB1Q02325 96 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 TMED4Q7Z7H5 227 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 MT1LQ93083 61 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 CRIPTQ9P021 101 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 MED31Q9Y3C7 131 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 MAP3K1Q13233 1512 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 DNAH5Q8TE73 4624 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 FAM186AA6NE01 2351 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 DOCK1Q14185 1865 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 LRRC37A3O60309 1634 aa-1.07□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 MED23Q9ULK4 1368 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 A6NIN4 97 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R17O96001 155 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 FDCSPQ8NFU4 85 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 RPRMQ9NS64 109 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 ZFHX3Q15911 3703 aa-1.08□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 BPTFQ12830 3046 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 PTPRMP28827 1452 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 UQCRQO14949 82 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 UQCR11O14957 56 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 MGPP08493 103 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 UBE2D1P51668 147 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 TPPP2P59282 170 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 CCDC32Q9BV29 185 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 V9GYH0 126 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 BCORQ6W2J9 1755 aa-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SENP6-210ENST00000487548 SBF2Q86WG5 1849 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 A2MP01023 1474 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 J3QLW9 94 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SERPINB1P30740 379 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 TMEM78Q5T7P6 136 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 Q6AWC8 147 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 Q6ZUT4 128 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 BAGE2Q86Y30 109 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 STX12Q86Y82 276 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 CHMP6Q96FZ7 201 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-1.1□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 ALKQ9UM73 1620 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 ARHGEF5Q12774 1597 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 A0A1W2PRE2 83 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 CLPSL1A2RUU4 121 aa-1.11□□□□□ -2.59
SENP6-210ENST00000487548 RBP4P02753 201 aa-1.11□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms