RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 AMELXQ99217 191 aa7.3□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM243Q9BU79 118 aa7.3□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.3□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 PRO0255Q9UI72 69 aa7.3□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 CELA1Q9UNI1 258 aa7.3□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 GYPEP15421 78 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 HERVK_113P61574 105 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZUT4 128 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 NFE4Q86UQ8 179 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM104AQ969W3 186 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 RETNQ9HD89 108 aa7.29□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.28□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 H7C423 109 aa7.28□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 PAX4O43316 350 aa7.28□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP5G1P05496 136 aa7.28□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 PCP2Q8IVA1 136 aa7.28□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.28□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0J9YXV3 536 aa7.27□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 E9PLD3 99 aa7.27□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2L6O14933 153 aa7.27□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 SIVA1O15304 175 aa7.27□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.27□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.27□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.27□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.26□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 F5H768 121 aa7.26□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 BATFQ16520 125 aa7.26□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.26□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.26□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM101Q96IK0 257 aa7.26□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.25□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.25□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0J9YY99 117 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 HTN3P15516 51 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2D1P51668 147 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 GAGE6Q13070 117 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 C12orf74Q32Q52 190 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 HIGD1BQ9P298 99 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.24□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.23□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.23□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM223A0PJW6 202 aa7.23□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 HSD52Q0P140 79 aa7.23□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.23□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.23□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 B9D2Q9BPU9 175 aa7.23□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.23□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 TIRAPP58753 221 aa7.22□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 SEC11AP67812 179 aa7.22□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 MPV17L2Q567V2 206 aa7.22□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.22□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA25Q9BR10 227 aa7.22□□□□□ -1.25
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF815PA8K554 130 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 LEPROTO15243 131 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 LYSTQ99698 3801 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 RYR2Q92736 4967 aa7.21□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A096LPF7 62 aa7.2□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0J9YWU9 116 aa7.2□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 H3BRM9 83 aa7.2□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 J3QQQ9 107 aa7.2□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.2□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 HERVK_113P63121 156 aa7.2□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.19□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 H3BNG1 76 aa7.19□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.19□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.19□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.19□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.19□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 TENM3Q9P273 2699 aa7.19□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.18□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.18□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms