RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM18	Q96B42	140 aa		10.98	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		10.98	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		10.97	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		10.97	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		10.96	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	PSCA	O43653	123 aa		10.96	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		10.96	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		10.96	□□□□□ -0.65
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		10.96	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM104A	Q969W3	186 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM101	Q96IK0	257 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	EREG	O14944	169 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB5A	P20339	215 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	RYR1	P21817	5038 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	NPS	P0C0P6	89 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP10-2	P60368	255 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	WFDC2	Q14508	124 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8N814	137 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	CCL25	O15444	150 aa		10.91	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		10.91	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		10.9	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZUT4	128 aa		10.9	□□□□□ -0.66
HCLS1-208	ENST00000487290	G0S2	P27469	103 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	BAALC	Q8WXS3	180 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	HERC2	O95714	4834 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC01549	A6NIU2	74 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	COLCA2	A8K830	154 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	C14orf177	Q52M58	125 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	IGIP	A6NJ69	53 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	FOXI1	Q12951	378 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	TOMM6	Q96B49	74 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	USP17L23	D6RBM5	183 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	TIMM17A	Q99595	171 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	C16orf90	A8MZG2	172 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	HSPG2	P98160	4391 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	LECT2	O14960	151 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	SS18	Q15532	418 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM141	Q96I45	108 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	AMELX	Q99217	191 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	FA2H	Q7L5A8	372 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	C15orf56	Q8N910	161 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A096LNJ9	63 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	PRSS1	P07477	247 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00614	P0C842	121 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	XCL1	P47992	114 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB5B	P61020	215 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	ERAS	Q7Z444	233 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	TRGC2	P03986	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	CFAP161	Q6P656	301 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	IFITM10	A6NMD0	228 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	SCO1	O75880	301 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2D1	P51668	147 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	CDK2AP2	O75956	126 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	S100A1	P23297	94 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290	GCSH	P23434	173 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZN92	141 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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