RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486862.1

OPTN-211, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 423 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-211ENST00000486862 LELP1Q5T871 98 aa7.47□□□□□ -1.21
OPTN-211ENST00000486862 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.47□□□□□ -1.21
OPTN-211ENST00000486862 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
OPTN-211ENST00000486862 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.47□□□□□ -1.21
OPTN-211ENST00000486862 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.47□□□□□ -1.21
OPTN-211ENST00000486862 VCX2Q9H322 139 aa7.47□□□□□ -1.21
OPTN-211ENST00000486862 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
OPTN-211ENST00000486862 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 IGKCP01834 107 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 PLNP26678 52 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 PKIAP61925 76 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 GAGE6Q13070 117 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZUT4 128 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 NFE4Q86UQ8 179 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 ATOH7Q8N100 152 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 VAMP8Q9BV40 100 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.46□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 IGLC3P0DOY3 106 aa7.45□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.45□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.45□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 TMEM101Q96IK0 257 aa7.45□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 MAJINQ3KP22 176 aa7.44□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 hDV102S1A0JD36 115 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 C11orf86A6NJI1 115 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 UBE2D1P51668 147 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 RBX1P62877 108 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 ESRGQ1W209 222 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 SPATA45Q537H7 98 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.42□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.42□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 A0A0J9YXV3 536 aa7.41□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 TMEM262E9PQX1 116 aa7.41□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.41□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 MPV17L2Q567V2 206 aa7.41□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.41□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.4□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 SEC11AP67812 179 aa7.4□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 STPG4Q8N801 248 aa7.4□□□□□ -1.22
OPTN-211ENST00000486862 IGLL5B9A064 214 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 TSTD3H0UI37 97 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 CCL25O15444 150 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 PRO1933Q9H354 126 aa7.39□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 E9PLD3 99 aa7.38□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 HERVK_113P63121 156 aa7.38□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 APLNQ9ULZ1 77 aa7.38□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 TMEM223A0PJW6 202 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 NUPR2A6NF83 97 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 COX8AP10176 69 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 TCTAP57738 103 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 HERVK_113P61574 105 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 Q8N3U1 123 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 UPK3BQ9BT76 320 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 PRR34Q9NV39 138 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.37□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.36□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 DLEU1O43261 78 aa7.36□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.36□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 CCL18P55774 89 aa7.36□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 COX6A2Q02221 97 aa7.36□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.36□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.36□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 H3BRM9 83 aa7.35□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 REG3AQ06141 175 aa7.35□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 SS18Q15532 418 aa7.35□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.35□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.35□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 C14orf144Q96I85 54 aa7.35□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.35□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.34□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.34□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 LEPROTO15243 131 aa7.34□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.34□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.34□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.34□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.34□□□□□ -1.23
OPTN-211ENST00000486862 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.33□□□□□ -1.24
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