RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.7□□□□□ -0.86
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 DLEU1O43261 78 aa9.7□□□□□ -0.86
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.65□□□□□ -0.86
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 RETNQ9HD89 108 aa9.64□□□□□ -0.87
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 C12orf74Q32Q52 190 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q6ZUT4 128 aa9.63□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.63□□□□□ -0.87
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM262E9PQX1 116 aa9.62□□□□□ -0.87
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.6□□□□□ -0.87
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 LELP1Q5T871 98 aa9.6□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.6□□□□□ -0.87
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.58□□□□□ -0.88
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.57□□□□□ -0.88
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF815PA8K554 130 aa9.57□□□□□ -0.88
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 SS18Q15532 418 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TAL2Q16559 108 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.57□□□□□ -0.88
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TENM3Q9P273 2699 aa9.57□□□□□ -0.88
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A096LPF7 62 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BATFQ16520 125 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM104AQ969W3 186 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A6NDN8 102 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RBX1P62877 108 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C3orf84H3BNL1 204 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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