RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GCFC2-208	ENST00000472230	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GCFC2-208	ENST00000472230	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		12.9	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	GYPE	P15421	78 aa		12.9	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230		G3V4G9	280 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00694	P0DN24	101 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM101	Q96IK0	257 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	PAX4	O43316	350 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230		H7C423	109 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	CELA1	Q9UNI1	258 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM223	A0PJW6	202 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF815P	A8K554	130 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	ATP5G1	P05496	136 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	LEPROT	O15243	131 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	UBE2D1	P51668	147 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	SEC11A	P67812	179 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE6	Q13070	117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230		J3QQQ9	107 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	RETN	Q9HD89	108 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A0J9YY99	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230		F5H768	121 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	HTN3	P15516	51 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	GCSH	P23434	173 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230		A6NDN8	102 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	TIRAP	P58753	221 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	TAL2	Q16559	108 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	HIST1H4G	Q99525	98 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	STAB1	Q9NY15	2570 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A096LPF7	62 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230		H3BRM9	83 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	HERVK_113	P63121	156 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	PTTG1IP	P53801	180 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	CEND1	Q8N111	149 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	SPINK8	P0C7L1	97 aa		12.77	□□□□□ -0.36
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	MAST4	O15021	2626 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM262	E9PQX1	116 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	COX11	Q9Y6N1	276 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	TAX1BP3	O14907	124 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	COX6A2	Q02221	97 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	TM2D2	Q9BX73	214 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	FXYD2	P54710	66 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	C12orf74	Q32Q52	190 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZVH6	145 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230	SMIM13	P0DJ93	91 aa		12.72	□□□□□ -0.37
GCFC2-208	ENST00000472230		K7EP13	123 aa		12.71	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1B0GUV1	79 aa		12.7	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		12.7	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A0J9YWU9	116 aa		12.69	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	RBX1	P62877	108 aa		12.69	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		12.69	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	RAB37	Q96AX2	223 aa		12.69	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	COL6A5	A8TX70	2615 aa		12.68	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	MDFI	Q99750	246 aa		12.68	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230		A6NJY4	79 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		12.67	□□□□□ -0.38

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