RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 CRYGDP07320 174 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 A8MZ25 164 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 SOCS3O14543 225 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 HERVK_113P61574 105 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 KLK12Q9UKR0 248 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 V9GYY9 64 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 XGP55808 180 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 AMN1Q8IY45 258 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 H3BMG7 143 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 NXPH4O95158 308 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 LEPROTL1O95214 131 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 CDIP1Q9H305 208 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 I3L3M4 83 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 GAGE2BQ13066 116 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 GAGE2EQ4V326 116 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 NUP35Q8NFH5 326 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 BAALCQ8WXS3 180 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 WIPF1O43516 503 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 MED14OSP0DP75 135 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0U1RRA0 63 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 K7ERJ3 54 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 D6R8Y8 96 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 GCSHP23434 173 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 C12orf74Q32Q52 190 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 F8W1H4 67 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 FGF6P10767 208 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 C4orf26Q17RF5 130 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZUT4 128 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 PDZD2O15018 2839 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 JPT2Q9H910 190 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 LINC01549A6NIU2 74 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 C9JAW5 83 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 SMKR1H3BMG3 65 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 ATP5LO75964 103 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM13P0DJ93 91 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 CELA1Q9UNI1 258 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 C14orf177Q52M58 125 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 NF1P21359 2839 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-215ENST00000462256 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.65□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 GTSF1Q8WW33 167 aa6.65□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 RASL10AQ92737 203 aa6.65□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 X6R8D5 127 aa6.65□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV2-8P01709 118 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 FAM236CP0DP71 79 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 PRR9Q5T870 116 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 SNCGO76070 127 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 Q9H8V8 135 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 Q8NAQ8 132 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 FXYD2P54710 66 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 RS1O15537 224 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 FOXI1Q12951 378 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 LAGE3Q14657 143 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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