RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A087WX48 190 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM262E9PQX1 116 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMIM6P0DI80 62 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC01545Q5VT33 79 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TEX43Q6ZNM6 134 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 Q8N976 141 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A1B0GUV1 79 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ODF1Q14990 250 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 Q6ZUT4 128 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF664Q8N3J9 261 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM104AQ969W3 186 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AMELXQ99217 191 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CST9LQ9H4G1 147 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RBX1P62877 108 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 F8VRH5 84 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCL18P55774 89 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TCTAP57738 103 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MPV17L2Q567V2 206 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C2orf88Q9BSF0 95 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 APLNQ9ULZ1 77 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PMCHL2Q9BQD1 86 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DPM2O94777 84 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGKCP01834 107 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLNP26678 52 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa10.38□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa10.37□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UBE2D1P51668 147 aa10.37□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATOH7Q8N100 152 aa10.37□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MUC7Q8TAX7 377 aa10.37□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A0J9YXV3 536 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGLC3P0DOY3 106 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SEC11AP67812 179 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 S100A12P80511 92 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZFAND6Q6FIF0 208 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NFE4Q86UQ8 179 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C12orf57Q99622 126 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UPK3BQ9BT76 320 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGHV3-30P01768 117 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGHV3-33P01772 117 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC01556Q5JQF7 62 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 Q8N3U1 123 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C11orf86A6NJI1 115 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HSBP1L1C9JCN9 74 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNAH10OSP0CZ25 163 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHAC1Q9BUX1 264 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 VAMP8Q9BV40 100 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SIVA1O15304 175 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCL25O15444 150 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 REG3AQ06141 175 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SS18Q15532 418 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KLK12Q9UKR0 248 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 hDV102S1A0JD36 115 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HERVK_113P63121 156 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRR34Q9NV39 138 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PAM16Q9Y3D7 125 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CRPP02741 224 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAJINQ3KP22 176 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STPG4Q8N801 248 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 Q9H8V8 135 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNAH7Q8WXX0 4024 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa10.29□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HERVK_113P61574 105 aa10.29□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPATA45Q537H7 98 aa10.29□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ENHOQ6UWT2 76 aa10.29□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC00469Q8N7U9 141 aa10.29□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TGP01266 2768 aa10.28□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.28□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 H3BRM9 83 aa10.28□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COX6A2Q02221 97 aa10.28□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C10orf126Q8N4M7 172 aa10.28□□□□□ -0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UBE2WQ96B02 151 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms