RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
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NEK1-201ENST00000439128 IGLV2-8P01709 118 aa8.85□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 ODF1Q14990 250 aa8.85□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 H3BMG7 143 aa8.85□□□□□ -0.99
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NEK1-201ENST00000439128 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
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NEK1-201ENST00000439128 UBE2D2P62837 147 aa8.8□□□□□ -1
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NEK1-201ENST00000439128 CLEC2BQ92478 149 aa8.8□□□□□ -1
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NEK1-201ENST00000439128 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.75□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 CASC2Q6XLA1 102 aa8.75□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 M0R378 163 aa8.75□□□□□ -1.01
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NEK1-201ENST00000439128 TSHBP01222 138 aa8.74□□□□□ -1.01
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NEK1-201ENST00000439128 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.74□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 C6orf223Q8N319 242 aa8.74□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.74□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 C1orf137Q5JT78 98 aa8.73□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.73□□□□□ -1.01
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NEK1-201ENST00000439128 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.73□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 A0A1B0GXF2 115 aa8.72□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 UPK3BQ9BT76 320 aa8.72□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.72□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.72□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.72□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.71□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 A8MZ25 164 aa8.71□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 SEC61GP60059 68 aa8.71□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 FHL2Q14192 279 aa8.71□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 ZNF580Q9UK33 172 aa8.71□□□□□ -1.01
NEK1-201ENST00000439128 FXYD2P54710 66 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 C6orf99Q4VX62 202 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 RNF185Q96GF1 192 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.71□□□□□ -1.02
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