RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 CDIP1Q9H305 208 aa8.89□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.89□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 I3L3M4 83 aa8.88□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.87□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 G3V3Q6 166 aa8.87□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 IFNA1P01562 189 aa8.87□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.87□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 MRAP2Q96G30 205 aa8.87□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 PMCHP20382 165 aa8.86□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 TWIST1Q15672 202 aa8.86□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 TPRXLQ17RH7 258 aa8.86□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.86□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 SMIM12Q96EX1 92 aa8.86□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 ALG5Q9Y673 324 aa8.86□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.85□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 DEFA1P59665 94 aa8.85□□□□□ -0.99
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NELFE-204ENST00000436289 Q5BKY6 102 aa8.85□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.85□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.85□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 CNFNQ9BYD5 112 aa8.85□□□□□ -0.99
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NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GVG6 124 aa8.84□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 ZNF861PO60384 105 aa8.84□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.84□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.84□□□□□ -0.99
NELFE-204ENST00000436289 CTRLP40313 264 aa8.83□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.83□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.83□□□□□ -1
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NELFE-204ENST00000436289 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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NELFE-204ENST00000436289 SPAG11BQ08648 103 aa8.82□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.82□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 FAM168BA1KXE4 195 aa8.81□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 CRYGAP11844 174 aa8.81□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 CTAG1AP78358 180 aa8.81□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.81□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 M0QXV9 152 aa8.8□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 NDUFA1O15239 70 aa8.8□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 CENPWQ5EE01 88 aa8.8□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 C11orf52Q96A22 123 aa8.8□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.79□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 UMAD1C9J7I0 102 aa8.79□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 C5orf38Q86SI9 138 aa8.79□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 ST20Q9HBF5 79 aa8.79□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 NUPR1O60356 82 aa8.78□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 TSHBP01222 138 aa8.78□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 CCL20P78556 96 aa8.78□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.78□□□□□ -1
NELFE-204ENST00000436289 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.77□□□□□ -1.01
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NELFE-204ENST00000436289 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 MUC17Q685J3 4493 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 GAGE2EQ4V326 116 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 A0A087X002 238 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 MANBALQ9NQG1 85 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GV50 99 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 NUDT11Q96G61 164 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.73□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.73□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 VCYO14598 125 aa8.72□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 C10orf25Q5T742 122 aa8.72□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.72□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 TMEM18Q96B42 140 aa8.72□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.72□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.72□□□□□ -1.01
NELFE-204ENST00000436289 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.71□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 RAB19A4D1S5 217 aa8.71□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.71□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 FCER1GP30273 86 aa8.71□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.71□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 PDE6DO43924 150 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 RGS21Q2M5E4 152 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFE-204ENST00000436289 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.7□□□□□ -1.02
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