RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
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SH3BP5-204ENST00000412806 CEND1Q8N111 149 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP5-204ENST00000412806 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP5-204ENST00000412806 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP5-204ENST00000412806 LURAP1LQ8IV03 231 aa15□□□□□ -0.01
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SH3BP5-204ENST00000412806 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa15□□□□□ -0.01
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SH3BP5-204ENST00000412806 H3BRM9 83 aa14.96□□□□□ -0.01
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SH3BP5-204ENST00000412806 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM262E9PQX1 116 aa14.93□□□□□ -0.02
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SH3BP5-204ENST00000412806 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.93□□□□□ -0.02
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SH3BP5-204ENST00000412806 K7EIL1 84 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP5-204ENST00000412806 RBX1P62877 108 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP5-204ENST00000412806 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP5-204ENST00000412806 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A0J9YWU9 116 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP5-204ENST00000412806 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GUV1 79 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP5-204ENST00000412806 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP5-204ENST00000412806 RAB37Q96AX2 223 aa14.9□□□□□ -0.02
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