RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDKN2CP42773 168 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 UBE2G1P62253 170 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 REEP5Q00765 189 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLLU1Q5K131 121 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 C10orf128Q5T292 105 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 C10orf82Q8WW14 230 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPTSSAQ969W0 71 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC115Q96NT0 180 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIGD1BQ9P298 99 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATPIF1Q9UII2 106 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 PITX3O75364 302 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDUFB6O95139 128 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 IL5P05113 134 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 SERPINB1P30740 379 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 GNG3P63215 75 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 MNS1Q8NEH6 495 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 THEM6Q8WUY1 208 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRAP1Q96NZ9 151 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEC11CQ9BY50 192 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 BANF2Q9H503 90 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPANXA1Q9NS26 97 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSENENQ9NZ42 101 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 SS18L2Q9UHA2 77 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-187P-201ENST00000384139 TANC2Q9HCD6 1990 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM186AA6NE01 2351 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLIP1P30622 1438 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTPRMP28827 1452 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 CEP290O15078 2479 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIAA0556O60303 1618 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 SFT2D2O95562 160 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEC11AP67812 179 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 MT1XP80297 61 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 NMSQ5H8A3 153 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM78Q5T7P6 136 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 MGST2Q99735 147 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 BOLA2Q9H3K6 86 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 COL4A6Q14031 1691 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADGBQ8N7X0 1667 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 IFT140Q96RY7 1462 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 WDR97A6NE52 1622 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGLC7A0M8Q6 106 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 J3QR89 54 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 M0QX08 132 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 SNCAP37840 140 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 C9orf153Q5TBE3 101 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 HRCT1Q6UXD1 115 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 WFDC13Q8IUB5 93 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 COPS9Q8WXC6 57 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 UQCR10Q9UDW1 63 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 S4R3F8 94 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADCY9O60503 1353 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLB1Q6P1J6 1458 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 NLRP1Q9C000 1473 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 PARP14Q460N5 1801 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM238C9JI98 176 aa-0.75□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.8 ms