RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 PATJQ8NI35 1801 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 DOCK2Q92608 1830 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC58Q4VC31 144 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEIG1Q5JSS6 88 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q6AWC8 147 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARL11Q969Q4 196 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00470Q9BZP3 86 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAA60Q9H7X0 242 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRP6O75581 1613 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 MUC2Q02817 5179 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFTRP13569 1480 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMELXQ99217 191 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 DOCK1Q14185 1865 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 F8VRH5 84 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 UQCR11O14957 56 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNG7O60262 68 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOC3P02656 99 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRM1P04553 51 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPPP2P59282 170 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q6JHZ5 121 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACANP16112 2415 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCL9LQ86UU0 1499 aa-0.35□□□□□ -2.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 I3L2K1 104 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q56UQ5 140 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 MGST2Q99735 147 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00472Q9H8W2 130 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAMC1P11047 1609 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFA2O43678 99 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL6A3P12111 3177 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLC7A0M8Q6 106 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNFP01375 233 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX6B1P14854 86 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTG2P78543 158 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSLPQ969D9 159 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPANXDQ9BXN6 97 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYH7P12883 1935 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDZD2O15018 2839 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7EQZ3 153 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOC2P02655 101 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSC22D3Q99576 134 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAPPAQ13219 1627 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAIPQ13075 1403 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSSCA1O60232 199 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFNGP01579 166 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 S100A12P80511 92 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 CATR1Q13166 79 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 RYR3Q15413 4870 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSC2P49815 1807 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSME4Q14997 1843 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMGN4O00479 90 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGF7P21781 194 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPRR1BP22528 89 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM107BQ9H098 131 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCHHQ07283 1943 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7EP13 123 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPINK4O60575 86 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFT2D2O95562 160 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPRR2BP35325 72 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-78P-201ENST00000362897 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-0.41□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms