RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNG3P63215 75 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLLU1Q5K131 121 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMIM20Q8N5G0 67 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFHX3Q15911 3703 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADCY9O60503 1353 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 SBF2Q86WG5 1849 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 YPEL1O60688 119 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 BAGE2Q86Y30 109 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q8N8P6 123 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC32Q9BV29 185 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRIPTQ9P021 101 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 FRYQ5TBA9 3013 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERCC6Q03468 1493 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLB1Q6P1J6 1458 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 PXDNQ92626 1479 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 UQCR11O14957 56 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 NIPSNAP2O75323 286 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 MT1HL1P0DM35 61 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDKN2CP42773 168 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALX1Q15699 326 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 V9GYH0 126 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYH3P11055 1940 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 M0QX08 132 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMIM24O75264 130 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCL8P80075 99 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 THEM6Q8WUY1 208 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R14BQ96C90 147 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 C5orf42Q9H799 3197 aa-1.97□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.97□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACACBO00763 2458 aa-1.97□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 KDM5CP41229 1560 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 E2F6O75461 281 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM107AO95990 144 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOC3P02656 99 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 MT-ND4LP03901 98 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 CBLN1P23435 193 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 LELP1Q5T871 98 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 C10orf113Q5VZT2 155 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC115Q96NT0 180 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 CALML5Q9NZT1 146 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGEF10O15013 1369 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTXN2P0C2S0 81 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCTAP57738 103 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPPP2P59282 170 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 MIC13Q5XKP0 118 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 STX12Q86Y82 276 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP19Q96LK0 163 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 BANF2Q9H503 90 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 LENEPQ9Y5L5 61 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP290O15078 2479 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 DISP2A7MBM2 1401 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PRE2 83 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIX6O95475 246 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAEPP09466 180 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 S100A5P33763 92 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGS21Q2M5E4 152 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 S100A7L2Q5SY68 101 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 C10orf128Q5T292 105 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM244Q5VVB8 128 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCIMPQ6UWF3 145 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFAP53Q96M91 514 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYH8P13535 1937 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 DAPK1P53355 1430 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGLC7A0M8Q6 106 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM78Q5T7P6 136 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 HEPN1Q6WQI6 88 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 S4R3F8 94 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PATJQ8NI35 1801 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 HCG22E2RYF7 251 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 I3L3M4 83 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPM2O94777 84 aa-2.02□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms