RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323829.9

SH3TC2-201, Transcript of SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SH3TC2, Length 7,324 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2-201ENST00000323829 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3TC2-201ENST00000323829 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3TC2-201ENST00000323829 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.71□□□□□ -1.33
SH3TC2-201ENST00000323829 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.71□□□□□ -1.33
SH3TC2-201ENST00000323829 HIGD1BQ9P298 99 aa6.71□□□□□ -1.33
SH3TC2-201ENST00000323829 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.71□□□□□ -1.33
SH3TC2-201ENST00000323829 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 COL4A3Q01955 1670 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 MDFICQ9P1T7 246 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 Q6ZR03 302 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 Q9UF83 564 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 H3BUA1 57 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 MYCNOSP40205 109 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 PROK2Q9HC23 129 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 IGLV1-44P01699 117 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 LST1O00453 97 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 SYCNQ0VAF6 134 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 MIAQ16674 131 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 TOMM6Q96B49 74 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 C15orf65H3BRN8 121 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 MSMPQ1L6U9 139 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 WT1-ASQ06250 92 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 C6orf99Q4VX62 202 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 C11orf86A6NJI1 115 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 C1orf137Q5JT78 98 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 SORL1Q92673 2214 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 LY6G6DO95868 133 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 A0A1B0GU69 56 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 A0A1B0GXF2 115 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 hDV103S1A0JD37 113 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 HCFC1P51610 2035 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 LINC00311Q8N616 119 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 LINC00694P0DN24 101 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 H0Y9P7 68 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 XGP55808 180 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 IMUPQ9GZP8 106 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 TMEM131Q92545 1883 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 Q6ZTI0 123 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3TC2-201ENST00000323829 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.65□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.65□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.65□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.65□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 E9PLD3 99 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 APLNQ9ULZ1 77 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 M0QXV9 152 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 Q8N976 141 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 NDUFA7O95182 113 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 RITA1Q96K30 269 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 A0A0J9YXY3 114 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 A8MZ25 164 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 C19orf84I3L1E1 186 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 P0C879 139 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 C2orf48Q96LS8 159 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 PRAC2D3DTV9 90 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 HCG22E2RYF7 251 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 REG3GQ6UW15 175 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 AGRNO00468 2067 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 M0R378 163 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 RNF185Q96GF1 192 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3TC2-201ENST00000323829 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms