RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 GYPEP15421 78 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 STPG4Q8N801 248 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 C14orf144Q96I85 54 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 F5H768 121 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2L6O14933 153 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFA6Q01524 100 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM243Q9BU79 118 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00587B1AMM8 73 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM101Q96IK0 257 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA25Q9BR10 227 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 CELA1Q9UNI1 258 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 NACAE9PAV3 2078 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 COX8AP10176 69 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF6P10767 208 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 HTN3P15516 51 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 AMELXQ99217 191 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 RETNQ9HD89 108 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0J9YY99 117 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 K7EIL1 84 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00694P0DN24 101 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 NMUP48645 174 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 HERVK_113P61574 105 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf74Q32Q52 190 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 DLEU1O43261 78 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 SLPIP03973 132 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
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RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 MRAPQ8TCY5 172 aa7.05□□□□□ -1.28
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RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0J9YWU9 116 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf86A6NJI1 115 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM262E9PQX1 116 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BNG1 76 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R143 59 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 SIVA1O15304 175 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 CTAG1AP78358 180 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0J9YXV3 536 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 E9PLD3 99 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 TCTAP57738 103 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE6Q13070 117 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZUT4 128 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM104AQ969W3 186 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GUV1 79 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 TIRAPP58753 221 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 PCP2Q8IVA1 136 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A096LPF7 62 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BRM9 83 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2D1P51668 147 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 HERVK_113P63121 156 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZTC4 211 aa7.01□□□□□ -1.29
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