RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 X6R8D5 127 aa8.56□□□□□ -1.04
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HDGFL3-201ENST00000299633 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.56□□□□□ -1.04
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.56□□□□□ -1.04
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HDGFL3-201ENST00000299633 CELA1Q9UNI1 258 aa8.55□□□□□ -1.04
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HDGFL3-201ENST00000299633 PLA2G5P39877 138 aa8.55□□□□□ -1.04
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HDGFL3-201ENST00000299633 PROK2Q9HC23 129 aa8.52□□□□□ -1.05
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HDGFL3-201ENST00000299633 H7C423 109 aa8.5□□□□□ -1.05
HDGFL3-201ENST00000299633 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.5□□□□□ -1.05
HDGFL3-201ENST00000299633 Q6ZS92 163 aa8.5□□□□□ -1.05
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HDGFL3-201ENST00000299633 H0Y9P7 68 aa8.48□□□□□ -1.05
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HDGFL3-201ENST00000299633 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HDGFL3-201ENST00000299633 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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HDGFL3-201ENST00000299633 SPINK1P00995 79 aa8.43□□□□□ -1.06
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.43□□□□□ -1.06
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HDGFL3-201ENST00000299633 A6NDX4 124 aa8.43□□□□□ -1.06
HDGFL3-201ENST00000299633 Q96MF0 132 aa8.43□□□□□ -1.06
HDGFL3-201ENST00000299633 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.43□□□□□ -1.06
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HDGFL3-201ENST00000299633 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
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