RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFA3P59666 94 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2BP63146 152 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX261Q6UWH6 196 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf48Q96LS8 159 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 IMMP2LQ96T52 175 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 COX7A2LO14548 114 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN13O95857 204 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL2P10415 239 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 NTF3P20783 257 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 F8WDY8 70 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 ESDP10768 282 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF151Q2KHN1 245 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP35Q8NFH5 326 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 S100ZQ8WXG8 99 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 MRAP2Q96G30 205 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 BIN3Q9NQY0 253 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-201ENST00000296642 PMCHP20382 165 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFA5Q16718 116 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZNX1 250 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 I3L3M4 83 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL2L11O43521 198 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00299Q6ZSB3 139 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 PAGE4O60829 102 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA1P01562 189 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLC6P0CF74 106 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYGAP11844 174 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFA1P59665 94 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAG11BQ08648 103 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 TWIST1Q15672 202 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF726P1Q15940 193 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 TMUB2Q71RG4 321 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 MARVELD1Q9BSK0 173 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG5Q9Y673 324 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 G3V3Q6 166 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFA1O15239 70 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 NUPR1O60356 82 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF861PO60384 105 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 TPRXLQ17RH7 258 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM12Q96EX1 92 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 M0QXV9 152 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 GATD1Q8NB37 220 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM18Q96B42 140 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 UPK1BO75841 260 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ST20Q9HBF5 79 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 UMAD1C9J7I0 102 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 FCER1GP30273 86 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 GNG4P50150 75 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE2EQ4V326 116 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf38Q86SI9 138 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX46H3BTG2 121 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CTRLP40313 264 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPWQ5EE01 88 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1B-201ENST00000296642 BORCS7Q96B45 105 aa4.64□□□□□ -1.67
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