RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 TENM3Q9P273 2699 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 RHODO00212 210 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 Q6ZUT4 128 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 TIMM17AQ99595 171 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 ZNF815PA8K554 130 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 USP17L23D6RBM5 183 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 RHOHQ15669 191 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 IL17DQ8TAD2 202 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 C16orf74Q96GX8 76 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 TMEM141Q96I45 108 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 K7EQD1 137 aa7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.22□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 H3BUT2 72 aa7.22□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.22□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 HIST1H4GQ99525 98 aa7.22□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 VPREB1P12018 145 aa7.21□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PSME3-201ENST00000293362 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.21□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.21□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 G3V4G9 280 aa7.21□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 HSD52Q0P140 79 aa7.21□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.21□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.2□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 E9PLD3 99 aa7.2□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 PTH2Q96A98 100 aa7.2□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 X6R8D5 127 aa7.2□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 A0A0J9YY99 117 aa7.2□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 SFTA2Q6UW10 78 aa7.2□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 SPINK8P0C7L1 97 aa7.19□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 HTN3P15516 51 aa7.19□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.19□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.19□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 MTURNQ8N3F0 131 aa7.19□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.19□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 FHL2Q14192 279 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 C3orf56Q8N813 242 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 INSL3P51460 131 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 GAGE6Q13070 117 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 J3QL48 77 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 UBE2D3P61077 147 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 HERVK_113P61574 105 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 UBE2D2P62837 147 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 MRAPQ8TCY5 172 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.18□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.17□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 J3QQQ9 107 aa7.17□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 COX6A2Q02221 97 aa7.17□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 CEND1Q8N111 149 aa7.17□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.17□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 LINC01620Q4KN68 170 aa7.17□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 RETNQ9HD89 108 aa7.17□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 A6NDN8 102 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 NPC2P61916 151 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 CELA1Q9UNI1 258 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 GYPEP15421 78 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 SEC11AP67812 179 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 AMELXQ99217 191 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 TMEM223A0PJW6 202 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 UBE2L6O14933 153 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 KRTAP10-11P60412 298 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 V9GYY9 64 aa7.16□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.15□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 NFE4Q86UQ8 179 aa7.15□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 HIGD1BQ9P298 99 aa7.15□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.15□□□□□ -1.26
PSME3-201ENST00000293362 LINC01549A6NIU2 74 aa7.15□□□□□ -1.27
PSME3-201ENST00000293362 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.15□□□□□ -1.27
PSME3-201ENST00000293362 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.15□□□□□ -1.27
PSME3-201ENST00000293362 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.15□□□□□ -1.27
PSME3-201ENST00000293362 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.14□□□□□ -1.27
PSME3-201ENST00000293362 APOMO95445 188 aa7.14□□□□□ -1.27
PSME3-201ENST00000293362 SMIM13P0DJ93 91 aa7.14□□□□□ -1.27
PSME3-201ENST00000293362 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.14□□□□□ -1.27
PSME3-201ENST00000293362 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 236.1 ms