RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 COX6A2Q02221 97 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 H7C423 109 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF415Q09FC8 603 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 MIAQ16674 131 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 Q9H8V8 135 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 MTORP42345 2549 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM101Q96IK0 257 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF702PQ9H963 129 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 LINC00694P0DN24 101 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 C3orf56Q8N813 242 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 PRORYQ9H606 182 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 ACANP16112 2415 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 CITED1Q99966 193 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC179H3BU77 68 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE12JA6NER3 117 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE4Q13068 117 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE5Q13069 117 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM89A2RUT3 159 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 PRB1P04280 392 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 SPANXCQ9NY87 97 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 TOMM7Q9P0U1 55 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 YAE1D1Q9NRH1 226 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 INSP01308 110 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 IFITM1P13164 125 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 Q8N2B8 174 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE6Q13070 117 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 Q6ZTI0 123 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 LST1O00453 97 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 STHQ8IWL8 128 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 PEMTQ9UBM1 199 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 Q6YL49 198 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 PLA2G2AP14555 144 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 KRTAP10-9P60411 292 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 NDUFA1O15239 70 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRH-201ENST00000263434 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 Q9HAA7 133 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 H3BT86 120 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 AKAP9Q99996 3911 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE7O76087 117 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE12FP0CL80 117 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE12GP0CL81 117 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE12IP0CL82 117 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 HERVK_113P63121 156 aa11□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 ODF3L2Q3SX64 289 aa11□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 SMIM1B2RUZ4 78 aa11□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 UBE2L6O14933 153 aa11□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 RS1O15537 224 aa11□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 C1orf158Q8N1D5 194 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV4-31P0DP07 118 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 ITPR3Q14573 2671 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 TRGV2A0A075B6R0 118 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 M0QXV9 152 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 DSCR9P59020 149 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 TIRAPP58753 221 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 K7EQD1 137 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 Q96MF0 132 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PTPRH-201ENST00000263434 FAM218AQ96MZ4 157 aa10.96□□□□□ -0.66
PTPRH-201ENST00000263434 A0A096LNT2 108 aa10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.9 ms