RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637500.1

TCF4-287, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-287	ENST00000637500	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	EDN3	P14138	238 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	CLCN7	P51798	805 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	DLG4	P78352	724 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	SPATS1	Q496A3	300 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500		A0A096LPE4	126 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500		A0A1W2PPZ6	126 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500		A6NHS1	94 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	B3GALT4	O96024	378 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	NEFM	P07197	916 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ATCAY	Q86WG3	371 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	CCNJL	Q8IV13	435 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ABHD4	Q8TB40	342 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	CORO1B	Q9BR76	489 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	GCM1	Q9NP62	436 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF862	O60290	1169 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	PEX10	O60683	326 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	LIG1	P18858	919 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	GRIA4	P48058	902 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ID3	Q02535	119 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	TTLL4	Q14679	1199 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF385B	Q569K4	471 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ABTB2	Q8N961	1025 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	TCF12	Q99081	682 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	SP110	Q9HB58	689 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	PIDD1	Q9HB75	910 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	PRMT3	O60678	531 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	TNFRSF21	O75509	655 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	PDGFA	P04085	211 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ERVFC1	P60507	584 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ISL2	Q96A47	359 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	CCDC120	Q96HB5	630 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	KCTD3	Q9Y597	815 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	SEMA7A	O75326	666 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	SASH1	O94885	1247 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	EOMES	O95936	686 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	HPX	P02790	462 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	SLFN14	P0C7P3	912 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	TNFRSF1A	P19438	455 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ZXDA	P98168	799 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	PDE3A	Q14432	1141 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	SSPN	Q14714	243 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	EDEM1	Q92611	657 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	TEPSIN	Q96N21	525 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TCF4-287	ENST00000637500	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	AP3B2	Q13367	1082 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	TTC6	Q86TZ1	520 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	PANK1	Q8TE04	598 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	MYLIP	Q8WY64	445 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	GLMN	Q92990	594 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	WDR26	Q9H7D7	661 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500		A0A1W2PP55	124 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	RAD21	O60216	631 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	PHACTR2	O75167	634 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	RAC2	P15153	192 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	ITPKA	P23677	461 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TCF4-287	ENST00000637500	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98

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