RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	INPP5A	Q14642	412 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	REC114	Q7Z4M0	266 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	DCAF5	Q96JK2	942 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	SPATA32	Q96LK8	384 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	GML	Q99445	158 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	CAPN10	Q9HC96	672 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	UBP1	Q9NZI7	540 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ALX3	O95076	343 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	SLFN14	P0C7P3	912 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	CHRNA4	P43681	627 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	SOX9	P48436	509 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ERVK-24	P63145	666 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ID3	Q02535	119 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	APOBR	Q0VD83	1088 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	NKD1	Q969G9	470 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	USP21	Q9UK80	565 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	NTF4	P34130	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	PREP	P48147	710 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	HDX	Q7Z353	690 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ATE1	O95260	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	BPNT1	O95861	308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ITGB2	P05107	769 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	FGR	P09769	529 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	DRD2	P14416	443 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	FANCG	O15287	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	NEFM	P07197	916 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	RASSF7	Q02833	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ARID5A	Q03989	594 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	GLB1	P16278	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF165	P49910	485 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	CLC	Q05315	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms