RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631037.2

LINC00969-333, human

TSL 5

Gene LINC00969, Length 451 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00969-333	ENST00000631037	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	12.89	□□□□□ -0.35	3e-11	■■■■■ 28.1
LINC00969-333	ENST00000631037	PTPRF	P10586	1907 aa		12.88	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	CDH23	Q9H251	3354 aa		12.88	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	COA7	Q96BR5	231 aa		12.88	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		12.88	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		12.87	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	POTEB2	H3BUK9	544 aa		12.87	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		12.87	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	IL16	Q14005	1332 aa		12.87	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	RPTOR	Q8N122	1335 aa		12.87	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	HMGCR	P04035	888 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	PTPRA	P18433	802 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	MAP3K10	Q02779	954 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	AK9	Q5TCS8	1911 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	PDE8B	O95263	885 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	PICK1	Q9NRD5	415 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	DOCK2	Q92608	1830 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	ALDH1L1	O75891	902 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	SYN1	P17600	705 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	TCP10	Q12799	353 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	NFIA	Q12857	509 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	WWC1	Q8IX03	1113 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	KAZALD1	Q96I82	304 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	GUCD1	Q96NT3	240 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	PNMA3	Q9UL41	463 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LINC00969-333	ENST00000631037		F6X3S4	739 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	VAMP4	O75379	141 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	GJD2	Q9UKL4	321 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	PFAS	O15067	1338 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	DOCK1	Q14185	1865 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	ENTPD3	O75355	529 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	COL6A1	P12109	1028 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	FGFR2	P21802	821 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	NBR1	Q14596	966 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	METTL24	Q5JXM2	366 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	IDI2	Q9BXS1	227 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	UTY	O14607	1347 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	LRRC24	Q50LG9	513 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	SUCLG2	Q96I99	432 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	USP40	Q9NVE5	1235 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	PLXNB2	O15031	1838 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	TRIM75P	A6NK02	468 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	TRIB2	Q92519	343 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	TBC1D12	O60347	775 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	PRDX5	P30044	214 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	RGS3	P49796	1198 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	TRIM32	Q13049	653 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
LINC00969-333	ENST00000631037	TREML2	Q5T2D2	321 aa		12.78	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms