RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TAOK2Q9UL54 1235 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SALL1Q9NSC2 1324 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF20L1A8MW92 1017 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ELNP15502 786 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF521Q96K83 1311 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA3EO15041 775 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ENTPD3O75355 529 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FLT3LGP49771 235 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH13Q9UKX3 1938 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ATRNL1Q5VV63 1379 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 CIAO1O76071 339 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SGPL1O95470 568 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 INHAP05111 366 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 IDI2Q9BXS1 227 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO3Q9UK99 471 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM75PA6NK02 468 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 TFRCP02786 760 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PICALMQ13492 652 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCF2Q9UG63 623 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 E9PSI1 815 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 EVI5O60447 810 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SLF2Q8IX21 1173 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SMC4Q9NTJ3 1288 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ADORA1P30542 326 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 IL15P40933 162 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB118Q96PH6 123 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 GAKO14976 1311 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SLURP2P0DP57 97 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC102BQ68D86 513 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 BTDP43251 543 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 PXYLP1Q8TE99 480 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 COA7Q96BR5 231 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 IRF5Q13568 498 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 PRO3102Q9H379 93 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 RFX7Q2KHR2 1363 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 DOCK2Q92608 1830 aa33.95■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 RASGRF1Q13972 1273 aa33.95■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH1L2Q3SY69 923 aa33.95■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 PNMA3Q9UL41 463 aa33.95■■■■□ 3.03
CAPNS1-217ENST00000629983 HDAC5Q9UQL6 1122 aa33.94■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K10Q02779 954 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TREML2Q5T2D2 321 aa33.92■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN2P17655 700 aa33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM10P62072 90 aa33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM196BA6NMK8 535 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ERICH6Q7L0X2 663 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 MGAMO43451 1857 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPC1 479 aa33.89■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 SLFN5Q08AF3 891 aa33.89■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM110CQ1W6H9 321 aa33.89■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP33.89■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 STAP2Q9UGK3 403 aa33.89■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 SZT2Q5T011 3432 aa33.89■■■■□ 3.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC17A8Q8NDX2 589 aa33.88■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 COPRSQ9NQ92 184 aa33.88■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MECOMQ03112 1051 aa33.87■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NECAB2Q7Z6G3 386 aa33.87■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 DOCK1Q14185 1865 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GUL7 405 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SPP2Q13103 211 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MVPQ14764 893 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 XAGE2Q96GT9 111 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP2Q9Y2D5 859 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH2Q9UKX2 1941 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB22O15209 634 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D12O60347 775 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RHBDL3P58872 404 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.013e-8■■□□□ 13.7
CAPNS1-217ENST00000629983 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
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