RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619306.4

PTGS1-207, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTGS1, Length 5,051 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-207ENST00000619306 GUCA1BQ9UMX6 200 aa11.3□□□□□ -0.6
PTGS1-207ENST00000619306 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
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PTGS1-207ENST00000619306 NEURL1BA8MQ27 555 aa11.3□□□□□ -0.6
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PTGS1-207ENST00000619306 TUBB8Q3ZCM7 444 aa11.3□□□□□ -0.6
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PTGS1-207ENST00000619306 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.29□□□□□ -0.6
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PTGS1-207ENST00000619306 SNX16P57768 344 aa11.29□□□□□ -0.6
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PTGS1-207ENST00000619306 KRT40Q6A162 431 aa11.29□□□□□ -0.6
PTGS1-207ENST00000619306 CEP170Q5SW79 1584 aa11.28□□□□□ -0.6
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PTGS1-207ENST00000619306 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.28□□□□□ -0.6
PTGS1-207ENST00000619306 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa11.28□□□□□ -0.6
PTGS1-207ENST00000619306 FBF1Q8TES7 1133 aa11.28□□□□□ -0.6
PTGS1-207ENST00000619306 USP44Q9H0E7 712 aa11.28□□□□□ -0.6
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PTGS1-207ENST00000619306 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.28□□□□□ -0.6
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PTGS1-207ENST00000619306 ZNF202O95125 648 aa11.28□□□□□ -0.6
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PTGS1-207ENST00000619306 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.6
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PTGS1-207ENST00000619306 BRD1O95696 1058 aa11.27□□□□□ -0.61
PTGS1-207ENST00000619306 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PTGS1-207ENST00000619306 FANCCQ00597 558 aa11.27□□□□□ -0.61
PTGS1-207ENST00000619306 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.27□□□□□ -0.61
PTGS1-207ENST00000619306 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.27□□□□□ -0.61
PTGS1-207ENST00000619306 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.27□□□□□ -0.61
PTGS1-207ENST00000619306 PHKG2P15735 406 aa11.27□□□□□ -0.61
PTGS1-207ENST00000619306 SLC1A4P43007 532 aa11.27□□□□□ -0.61
PTGS1-207ENST00000619306 CFAP58Q5T655 872 aa11.27□□□□□ -0.61
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