RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 TNFAIP1Q13829 316 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 TXKP42681 527 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 USH1GQ495M9 461 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 KIFAP3Q92845 792 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 DNAI1Q9UI46 699 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CSADQ9Y600 493 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 STX10O60499 249 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 GTF2IP78347 998 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 PDE4DQ08499 809 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 USP40Q9NVE5 1235 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CTAGE9A4FU28 777 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CPA1P15085 419 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 TRPC3Q13507 836 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 ZAP70P43403 619 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CTSWP56202 376 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 TEKT1Q969V4 418 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 NDC80O14777 642 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.223e-10■■■■■ 35
CTDP1-208ENST00000613122 CEP63Q96MT8 703 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 WDR70Q9NW82 654 aa22.64■■□□□ 1.22
CTDP1-208ENST00000613122 PPP2R5BQ15173 497 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 M0QZ92 97 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 PHKG2P15735 406 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 DNM2P50570 870 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 FAM227BQ96M60 508 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CFBP00751 764 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1B0GVL5 298 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 TTC38Q5R3I4 469 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC63Q8NA47 563 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 NEO1Q92859 1461 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA1Q92805 767 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 TXNDC16Q9P2K2 825 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 RNF34Q969K3 372 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 ATP2B4P23634 1241 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 C8orf34Q49A92 452 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 TERF1P54274 439 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CBX1P83916 185 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 ANO1Q5XXA6 986 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 TFAP4Q01664 338 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC14Q49A88 953 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 KIFC2Q96AC6 838 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 IFNKQ9P0W0 207 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 PZPP20742 1482 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 LTKP29376 864 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 FAM107BQ9H098 131 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 DNM3Q9UQ16 869 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 GAS8O95995 478 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms