RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605910.1

TRAM2-AS1-202, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 1,053 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CNTROBQ8N137 903 aa11.18□□□□□ -0.62
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SPATA5Q8NB90 893 aa11.18□□□□□ -0.62
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.16□□□□□ -0.62
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GSTO1P78417 241 aa11.15□□□□□ -0.62
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SCARF1Q14162 830 aa11.15□□□□□ -0.62
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CFAP100Q494V2 611 aa11.15□□□□□ -0.62
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.15□□□□□ -0.62
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SMC5Q8IY18 1101 aa11.15□□□□□ -0.62
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SULF1Q8IWU6 871 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.11□□□□□ -0.63
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PBX2P40425 430 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TNNI2P48788 182 aa11.11□□□□□ -0.63
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TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MECOMQ03112 1051 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
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