RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		10.91	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLTPD2	A6NH11	291 aa		10.91	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM22	K7EJ46	135 aa		10.91	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.91	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF213	O14771	459 aa		10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTR9	Q6PD62	1173 aa		10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNB2	Q92953	911 aa		10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANAPC15	P60006	121 aa		10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	EVX2	Q03828	476 aa		10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCP10	Q12799	353 aa		10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYO1B	O43795	1136 aa		10.9	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP2D6	P10635	497 aa		10.9	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		10.9	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.9	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		10.9	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	IDI2	Q9BXS1	227 aa		10.9	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF3	Q9H094	633 aa		10.9	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.9	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	VEZT	Q9HBM0	779 aa		10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPARA	Q07869	468 aa		10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLCD1	P51178	756 aa		10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	SBK1	Q52WX2	424 aa		10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	C12orf60	Q5U649	245 aa		10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	INCENP	Q9NQS7	918 aa		10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576		E7EWF7	191 aa		10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL17RA	Q96F46	866 aa		10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		10.87	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		10.87	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT32	Q14532	448 aa		10.87	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		10.87	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.87	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	HACL1	Q9UJ83	578 aa		10.87	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		10.87	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		10.87	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CPA1	P15085	419 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ENTPD3	O75355	529 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYH1	P12882	1939 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNTNAP1	P78357	1384 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTEC	B2RU33	542 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPHX2	P34913	555 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEK1	Q96PY6	1258 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEDD4	P46934	1319 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRDM1	O75626	825 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	RABEP1	Q15276	862 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTC6	Q86TZ1	520 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	GGA3	Q9NZ52	723 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	LAMA4	Q16363	1823 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMA5	P28066	241 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEK4	P51957	841 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM83A	Q86UY5	434 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOMM22	Q9NS69	142 aa		10.85	□□□□□ -0.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms