RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	MPP2	Q14168	576 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	REC114	Q7Z4M0	266 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A0A0MRY4	1105 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	PTPRA	P18433	802 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	EPHA1	P21709	976 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	MKL1	Q969V6	931 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	GPATCH3	Q96I76	525 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	SAMM50	Q9Y512	469 aa		7.18	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM37	O94972	964 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ARNT	P27540	789 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	GIPR	P48546	466 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	GRIK4	Q16099	956 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ECEL1	O95672	775 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	BPNT1	O95861	308 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF165	P49910	485 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	IKBKE	Q14164	716 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	CRBN	Q96SW2	442 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAM23	O75077	832 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	SELP	P16109	830 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	HSD3B2	P26439	372 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC14	Q15048	493 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	PPP2R5E	Q16537	467 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	DDR2	Q16832	855 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	TNNI3K	Q59H18	835 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	MSL1	Q68DK7	614 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	PDZD3	Q86UT5	571 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	LILRB2	Q8N423	598 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNB2	Q92953	911 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	DNAJC7	Q99615	494 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608		B2RBV5	119 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	TM4SF5	O14894	197 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	CDC27	P30260	824 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	ELN	P15502	786 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	GSTM4	Q03013	218 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM177B	A6PVY3	158 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	ENPP3	O14638	875 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	FURIN	P09958	794 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	CHMP4BP1	P59074	171 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	FANCL	Q9NW38	375 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	ESYT3	A0FGR9	886 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608		H3BRJ5	948 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	GJB6	O95452	261 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	APBA3	O96018	575 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	ITGB7	P26010	798 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	GATA4	P43694	442 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	CABP4	P57796	275 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	RAC1	P63000	192 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATP9B-223	ENST00000590608	DOC2B	Q14184	412 aa		7.11	□□□□□ -1.27

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