RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 IGBP1P78318 339 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 CBLBQ13191 982 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 NFE2L2Q16236 605 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNB2Q92953 911 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 LGR6Q9HBX8 967 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 EP400Q96L91 3159 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 PPFIA3O75145 1194 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 SCNN1DP51172 638 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 GDF10P55107 478 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPROQ16827 1216 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PRU2 124 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 INHAP05111 366 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 NEFLP07196 543 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 NEFMP07197 916 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 SIK1P57059 783 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 ERVK-9P63128 1117 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 USP48Q86UV5 1035 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 PALLDQ8WX93 1383 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 BTAF1O14981 1849 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB11FIP3O75154 756 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 CTSHP09668 335 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 PRKAR2BP31323 418 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 GJA8P48165 433 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF827Q17R98 1081 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 IL17REQ8NFR9 667 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 SETDB2Q96T68 719 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 MTFR1LQ9H019 292 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 NHSQ6T4R5 1651 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 GIPC1O14908 333 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 ZBTB7AO95365 584 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 FGRP09769 529 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXK2Q01167 660 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 GPATCH3Q96I76 525 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 CSRNP1Q96S65 589 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 TEFQ10587 303 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 TCEAL1Q15170 157 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF394Q53GI3 561 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 MKL1Q969V6 931 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 POLIQ9UNA4 740 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.9□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 SCTRP47872 440 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ITPK1Q13572 414 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 TMX1Q9H3N1 280 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 RREB1Q92766 1687 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGB4P16144 1822 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ZBTB39O15060 712 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 UPP2O95045 317 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 KRT76Q01546 638 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC39A6Q13433 755 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 MTFR1Q15390 333 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC181Q5TID7 509 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms