RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494		F8W735	103 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	AOC2	O75106	756 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	COBL	O75128	1261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	MCM4	P33991	863 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	DRD2	P14416	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDK8	P49336	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ID3	Q02535	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADH5	P11766	374 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP11	P51784	963 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	INPP5A	Q14642	412 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	HDX	Q7Z353	690 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	NKD1	Q969G9	470 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAB6A	P20340	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	GART	P22102	1010 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	NOS3	P29474	1203 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHRNA4	P43681	627 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	ASPA	P45381	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	CRK	P46108	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	MPP2	Q14168	576 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	DOC2B	Q14184	412 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM221A	A4D161	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	GREM1	O60565	184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	CILP	O75339	1184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	RXRB	P28702	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	PREP	P48147	710 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEDD4L-222	ENST00000588494	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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