RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 CXCL11O14625 94 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 RGS3P49796 1198 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 GAKO14976 1311 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 ADORA1P30542 326 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 FCGRTP55899 365 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 PTPRAP18433 802 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 IDI2Q9BXS1 227 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN6-204ENST00000587324 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 ELNP15502 786 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 CIAO1O76071 339 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 MAP3K10Q02779 954 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 PLXNB2O15031 1838 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 SIPA1L1O43166 1804 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 ENTPD3O75355 529 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 FLT3LGP49771 235 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 UBXN2AP68543 259 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 ADCY3O60266 1144 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 INHAP05111 366 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 RASGRF1Q13972 1273 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 FBXO3Q9UK99 471 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 SEMA3EO15041 775 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 ZBTB22O15209 634 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 SGPL1O95470 568 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC102BQ68D86 513 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF384Q8TF68 577 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 PICK1Q9NRD5 415 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 SLFN5Q08AF3 891 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 TRIM75PA6NK02 468 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 E9PSI1 815 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 TREML2Q5T2D2 321 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
UBXN6-204ENST00000587324 FAM196BA6NMK8 535 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 BTDP43251 543 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 RHBDL3P58872 404 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 PICALMQ13492 652 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 IRF5Q13568 498 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 MIER1Q8N108 512 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 DEFB118Q96PH6 123 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 TIMM10P62072 90 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 COPRSQ9NQ92 184 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 ABCF2Q9UG63 623 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 MEIS3Q99687 375 aa23.29■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.29■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 FOCADQ5VW36 1801 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 MECOMQ03112 1051 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 PI16Q6UXB8 463 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 LRCH3Q96II8 777 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN6-204ENST00000587324 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
UBXN6-204ENST00000587324 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UBXN6-204ENST00000587324 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms