RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-208ENST00000587269 PI16Q6UXB8 463 aa36.24■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 OTOP1Q7RTM1 612 aa36.24■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 FAM43AQ8N2R8 423 aa36.24■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa36.22■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 MCAMP43121 646 aa36.22■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 PICK1Q9NRD5 415 aa36.22■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 BTBD19C9JJ37 291 aa36.2■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 PANK1Q8TE04 598 aa36.2■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 SNRKQ9NRH2 765 aa36.2■■■■□ 3.39
SMAD2-208ENST00000587269 KIF22Q14807 665 aa36.19■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 DBNDD2Q9BQY9 259 aa36.19■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 PTPN22Q9Y2R2 807 aa36.16■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 TLR2O60603 784 aa36.15■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 BAG3O95817 575 aa36.15■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 RHBDL3P58872 404 aa36.14■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 CEP85Q6P2H3 762 aa36.14■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa36.14■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 ERC1Q8IUD2 1116 aa36.14■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 TEX11Q8IYF3 940 aa36.14■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 SCYL3Q8IZE3 742 aa36.14■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 KCNH4Q9UQ05 1017 aa36.14■■■■□ 3.38
SMAD2-208ENST00000587269 CXCL11O14625 94 aa36.13■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 ANKRD23Q86SG2 305 aa36.13■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 ZNF384Q8TF68 577 aa36.13■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 ZHX2Q9Y6X8 837 aa36.13■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 PHF20L1A8MW92 1017 aa36.12■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 NPM3O75607 178 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa36.12■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 DOCK2Q92608 1830 aa36.11■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 PDHXO00330 501 aa36.11■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 PLCG2P16885 1265 aa36.11■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP36.11■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 RFX7Q2KHR2 1363 aa36.11■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 MAP3K10Q02779 954 aa36.09■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 ATRNL1Q5VV63 1379 aa36.08■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 PTPRAP18433 802 aa36.08■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP36.08■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa36.08■■■■□ 3.37
SMAD2-208ENST00000587269 TBC1D12O60347 775 aa36.07■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 IGSF3O75054 1194 aa36.07■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 ZAP70P43403 619 aa36.07■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 DDX19BQ9UMR2 479 aa36.07■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 NBPF11Q86T75 865 aa36.06■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 HMMRO75330 724 aa36.05■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 GADL1Q6ZQY3 521 aa36.05■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 AACSQ86V21 672 aa36.05■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 CPA4Q9UI42 421 aa36.05■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 RCAN3Q9UKA8 241 aa36.05■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 COG6Q9Y2V7 657 aa36.04■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 TRIM34Q9BYJ4 488 aa36.03■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa36.03■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 IDH1O75874 414 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 GNRH1P01148 92 aa36.02■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa36.02■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 SLURP2P0DP57 97 aa36.01■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 PPP4CP60510 307 aa36.01■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 C17orf99Q6UX52 265 aa36.01■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa36.01■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 PI4KBQ9UBF8 816 aa36.01■■■■□ 3.36
SMAD2-208ENST00000587269 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 TRIM75PA6NK02 468 aa36■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 FAM196BA6NMK8 535 aa36■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 TMEM106CQ9BVX2 250 aa36■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 BCL11AQ9H165 835 aa36■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 APBB1O00213 710 aa35.99■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 CYP7A1P22680 504 aa35.99■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 HOXD10P28358 340 aa35.99■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa35.99■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 CAP1Q01518 475 aa35.98■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 MOGSQ13724 837 aa35.98■■■■□ 3.35
SMAD2-208ENST00000587269 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms