RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH1A1P00352 501 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 DGKZQ13574 1117 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 VGLL4Q14135 290 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 OTUD5Q96G74 571 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF341Q9BYN7 854 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 FAM198AQ9UFP1 575 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 FOCADQ5VW36 1801 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 HTTP42858 3142 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 GAKO14976 1311 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ENTPD3O75355 529 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 BAG3O95817 575 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ZAP70P43403 619 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 RGS3P49796 1198 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 IFNL1Q8IU54 200 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ZFPM1Q8IX07 1006 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD8Q96I13 439 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 RAB11FIP3O75154 756 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 INPP5BP32019 993 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 GJA5P36382 358 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2A2P52657 109 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ERO1BQ86YB8 467 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 IDI2Q9BXS1 227 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 DOCK1Q14185 1865 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 PTPRFP10586 1907 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 RFX7Q2KHR2 1363 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ATAD5Q96QE3 1844 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC85CA6NKD9 419 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 GPR25O00155 361 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 CCL15Q16663 113 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 SIRT2Q8IXJ6 389 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 TEX11Q8IYF3 940 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF384Q8TF68 577 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-214ENST00000583153 CENPFP49454 3210 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 FKTNO75072 461 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 PLCG2P16885 1265 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 CYP7A1P22680 504 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 RHBDL3P58872 404 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 MAP3K12Q12852 859 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 SNAPC2Q13487 334 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 PICK1Q9NRD5 415 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 SIPA1L1O43166 1804 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 PHIPQ8WWQ0 1821 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 IRF6O14896 467 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 CETPP11597 493 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 PPATQ06203 517 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 PTPN18Q99952 460 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 CFHR5Q9BXR6 569 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF112Q9UJU3 913 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 IGSF3O75054 1194 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 CRHR2Q13324 411 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 PPIL2Q13356 520 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 BRI3BPQ8WY22 251 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-214ENST00000583153 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms