RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 POTEDQ86YR6 584 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 TUBB2AQ13885 445 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 CARD6Q9BX69 1037 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 KRT5P13647 590 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 VWA3BQ502W6 1294 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf74Q6P047 294 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.88■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 TXNDC16Q9P2K2 825 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.88■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 TNFAIP3P21580 790 aa23.87■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 IP6K1Q92551 441 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 ASIC2Q16515 512 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.87■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF202O95125 648 aa23.86■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 MIPOL1Q8TD10 442 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.86■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 PSMC4P43686 418 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 GCP02774 474 aa23.86■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 SPOPO43791 374 aa23.85■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 TTC6Q86TZ1 520 aa23.85■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM169AQ9Y6X4 670 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 IL13P35225 146 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 KIFAP3Q92845 792 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 TEX11Q8IYF3 940 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM7Q9C029 511 aa23.84■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
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PTPRM-211ENST00000580170 CFAP157Q5JU67 520 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 B4DLN1 442 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 CHMP2AO43633 222 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRM-211ENST00000580170 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
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