RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCORLQ8N3X6 602 aa39.89■■■■□ 3.98
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FKBP1BP68106 108 aa39.88■■■■□ 3.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf69Q8N8R5 385 aa39.88■■■■□ 3.97
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HOOK2Q96ED9 719 aa39.87■■■■□ 3.97
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FLT1P17948 1338 aa39.87■■■■□ 3.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa39.86■■■■□ 3.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa39.86■■■■□ 3.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARMC9Q7Z3E5 817 aa39.81■■■■□ 3.96
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SDR42E1Q8WUS8 393 aa39.8■■■■□ 3.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAV1Q8NEY1 1877 aa39.79■■■■□ 3.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIP1O00291 1037 aa39.79■■■■□ 3.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTRA3P83110 453 aa39.79■■■■□ 3.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF15Q66K64 600 aa39.79■■■■□ 3.96
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa39.78■■■■□ 3.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MOB2Q70IA6 237 aa39.77■■■■□ 3.96
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GNAT2P19087 354 aa39.76■■■■□ 3.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM227BQ96M60 508 aa39.76■■■■□ 3.96
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0D9SFI3 127 aa39.75■■■■□ 3.95
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BMP2KLQ5H9B9 411 aa39.74■■■■□ 3.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDRGK1Q96HY6 314 aa39.74■■■■□ 3.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2Q2LH0YL09 131 aa39.72■■■■□ 3.95
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF341Q9BYN7 854 aa39.72■■■■□ 3.95
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KLRG1Q96E93 195 aa39.71■■■■□ 3.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCM9Q9NXL9 1143 aa39.71■■■■□ 3.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIPA1L1O43166 1804 aa39.71■■■■□ 3.95
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB115Q30KQ5 88 aa39.7■■■■□ 3.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 LDLRAD1Q5T700 205 aa39.7■■■■□ 3.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIMAP6Q6P9H5 292 aa39.7■■■■□ 3.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC6Q86TZ1 520 aa39.7■■■■□ 3.95
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GSG1L2A8MUP6 293 aa39.69■■■■□ 3.94
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 WRNIP1Q96S55 665 aa39.67■■■■□ 3.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa39.66■■■■□ 3.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP39.66■■■■□ 3.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF112Q9UJU3 913 aa39.66■■■■□ 3.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 EHD4Q9H223 541 aa39.65■■■■□ 3.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC171Q6TFL3 1326 aa39.65■■■■□ 3.94
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