RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572936.5

MPDU1-211, Transcript of mannose-P-dolichol utilization defect 1, humanhuman

TSL 5

Gene MPDU1, Length 1,102 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPDU1-211ENST00000572936 WRNIP1Q96S55 665 aa22.29■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 SNRKQ9NRH2 765 aa22.29■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 USP40Q9NVE5 1235 aa22.29■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 DOCK2Q92608 1830 aa22.29■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 APBB1O00213 710 aa22.28■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 GSTO1P78417 241 aa22.28■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.28■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 ZNF384Q8TF68 577 aa22.28■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.28■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 RAI14Q9P0K7 980 aa22.28■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.28■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 LDHCP07864 332 aa22.27■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 ARHGEF6Q15052 776 aa22.27■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 ERO1BQ86YB8 467 aa22.27■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 FAM151AQ8WW52 585 aa22.27■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.27■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 EFCC1Q9HA90 598 aa22.27■■□□□ 1.16
MPDU1-211ENST00000572936 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.26■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 BTDP43251 543 aa22.26■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 ZAP70P43403 619 aa22.26■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 NFIAQ12857 509 aa22.26■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.26■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.25■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.25■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 IGSF3O75054 1194 aa22.25■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 CETPP11597 493 aa22.25■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 IDI2Q9BXS1 227 aa22.25■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.25■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.24■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 TCP10Q12799 353 aa22.24■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 SNAPC2Q13487 334 aa22.24■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.24■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.24■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.24■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 FOCADQ5VW36 1801 aa22.22■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 ENTPD3O75355 529 aa22.22■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 RGS3P49796 1198 aa22.22■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.22■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 CRBNQ96SW2 442 aa22.22■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.22■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 IRF6O14896 467 aa22.21■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 RHBDL3P58872 404 aa22.21■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 PPIL2Q13356 520 aa22.21■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 DCTPP1Q9H773 170 aa22.21■■□□□ 1.15
MPDU1-211ENST00000572936 PPATQ06203 517 aa22.2■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 BCL11AQ9H165 835 aa22.2■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.2■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 HTTP42858 3142 aa22.19■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 KIF22Q14807 665 aa22.19■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.19■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.19■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 SLC34A2O95436 690 aa22.18■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 BAG3O95817 575 aa22.18■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 INPP5BP32019 993 aa22.18■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 PICALMQ13492 652 aa22.18■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 BTBD19C9JJ37 291 aa22.17■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 TLR2O60603 784 aa22.17■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 NBPF11Q86T75 865 aa22.17■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.17■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 MYH7P12883 1935 aa22.17■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 PLCG2P16885 1265 aa22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 PPP4CP60510 307 aa22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 MAP3K12Q12852 859 aa22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 TEX11Q8IYF3 940 aa22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.16■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 CENPFP49454 3210 aa22.15■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 CYP7A1P22680 504 aa22.15■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.15■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.15■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 ARMC5Q96C12 935 aa22.15■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.15■■□□□ 1.14
MPDU1-211ENST00000572936 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MPDU1-211ENST00000572936 ATP5JP18859 108 aa22.14■■□□□ 1.13
MPDU1-211ENST00000572936 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.14■■□□□ 1.13
MPDU1-211ENST00000572936 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
MPDU1-211ENST00000572936 DOCK1Q14185 1865 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms